Naujausių laikų FK “Sūduva” istorija prasideda nuo 2001-2002 m, kai buvo iškovota teisė žaisti A lygoje ir pasiektas LFF taurės finalas. “Sūduva” pakeliui į 2002 m. LFF taurės finalą įveikė Kuršėnų “Ventą” 7:2(5:0), Kėdainių “Nevėžį”-2 – 6:1(1:1),  Klaipėdos “Atlantą” – 2:1(0:1). Ketvirtfinalyje “Sūduva” du kartus susitiko su Jonavos “Lietava”. Pirmąsias rungtynes marijampoliečiai laimėjo 4:3(3:1), antrosios baigėsi lygiosiomis 2:2(0:1). Pusfinalyje įnirtingoje kovoje buvo įveiktas Šiaulių “Sakalas” (Šiauliuose laimėta rezultatu 3:2, o Marijampolėje sužaista lygiosiomis 1:1). Finale buvo nusileista “Kauno” komandai 1:3. Patekimas į 2002 m. LFF taurės finalą “Sūduvai” garantavo vietą UEFA taurės turnyre. Tai buvo istorinis įvykis Marijampolės futbolo istorijoje. Kitas finalininkas FBK Kaunas jau turėjo iškovojęs teisę žaisti UEFA turnyre kaip Lietuvos čempionas.